Я бы удалил скайп и переустановил его.
sudo apt-get remove skype
Затем выполните обновление sudo. Убедитесь, что в пакетах нет ошибок.
Затем переустановите Skype, но затем обновите его, как это.
sudo apt-get install skype
sudo apt-get update && sudo apt-get upgrade
Так как это проблема со звуком, попробуйте эту тему: