Это звучит так же, как проблема, с которой я столкнулся. Смотрите ошибку # 1332623, связанную с Thunar. Я решил эту проблему, переключившись с thunar («Диспетчер файлов» в меню) на nautilus или pcmanfm.
Нет причин делать что-то особенное с USB-накопителем FAT32.