Когда Вы используете sudo pip install pandas
(с sudo), Вы используете двоичный файл в масштабе всей системы зернышка. Это, вероятно, расположено/usr/bin/pip. Необходимо активировать virtualenv и работать pip install pandas
без sudo. Чем Вы используют двоичный файл зернышка Вашего virtualenv. Теперь pip freeze
даст ожидаемые результаты.